Дисциплина Биофизика белка (7 семестр)

При описании структуры молекул используют понятия «конфигурация» и «конформация». Конфигурация определяется набором атомов и порядком их соединения.

Цис-бутилен и транс-бутилен имеют одинаковую конфигурацию, но разную конформацию.

Одним из параметров, описывающих конформацию, являются валентные углы. Валентный угол — угол между двумя связями, примыкающими к одному и тому же атому. Валентный угол — это т.н. плоский угол; связи, определяющие его, лежат в одной плоскости.

Большинство молекул состоят из атомов, не лежащих в одной плоскости. В таком случае валентные углы не позволяют однозначно описать конформацию молекулы.

Все валентные углы в этих молекулах равны 120°.

Молекулы H₂O₂ на рисунке выше имеют одинаковую конфигурацию и одинаковые валентные углы, но при этом имеют разную конформацию: как бы вы ни вращали эти молекулы, достичь одинакового положения всех атомов в пространстве не удастся. Нетрудно заметить единственную причину различий: в обоих случаях одна половина молекулы как бы повернута относительно другой (связь О–О — ось поворота), и направление этой закрученности у двух молекул разное.