Анализ сходства последовательностей в Clustal
Выполняем поиск первичных аминокислотных последовательностей
высокоорганизованных животных, имеющих ЦНС (кроме приматов):
Человек Human
Крыса Rat
Мышь Mouse
Кролик Rabbit
Морская свинка Guinea pig
Собака Dog
Кошка Cat
Свинья Pig
Бык Bovine
Лошадь Horse
Хомяк Hamster
Хорек Ferret
Курица Сhicken
Пресмыкающиеся
Земноводные
Рыбы
Не рассматриваем:
Приматы
Вирусы
Одноклеточные
Растения
Простейшие многоклеточные
Насекомые
1. Поиск в UniProt своего белка Human:
Файл fasta и web-страница с описанием белка человека
2. Поиск в UniProt своего белка для остальных организмов:
Файлы fasta в отдельной папке
Название файла должно содержать код белка, обозначение белка и название животного
3. Попарные сравнения:
- в Clustal
В отдельной папке должны быть пары файлов aln и dnd по всем сравнениям
Прикрепляемые файлы:
1. Файлы с fasta-описанием всех сравниваемых белков.
Название файла должно содержать код белка, обозначение белка и название животного
2. Файлы попарных сравнений в Clustal.
3. Заполненная и обработанная Excel-таблица по результатам сравнений.
Названия животных в таблицу вносить на русском языке