Ситуационные задачи
Задача 1. Ученый изучает генетическое заболевание породистых собак. Ему необходимо найти все известные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в гене, ассоциированном с этой болезнью, для породы лабрадор-ретривер. Какой раздел крупной геномной базы данных, такой как NCBI, будет основным для такого поиска?
Задача 2. Ветеринарный врач получил данные полногеномного секвенирования от кошки с подозрением на наследственное заболевание. Чтобы найти причинную мутацию, он планирует сравнить геном пациента с эталонным геномом. Как называется основной тип файла, используемый для хранения информации о выявленных вариантах последовательности ДНК относительно эталонного генома?
Задача 3. Исследователь хочет найти все белки, ассоциированные с мышечной дистрофией у собак, и увидеть их трехмерную структуру. В какой специализированной базе данных белковых структур ему следует искать?