Дисциплина Экспериментальная патобиохимия клетки

классификация по структуре (строению) и происхождению от однотипных генов.

По этому принципу, например, выделяют три семейства лиганд-активируемых ионных каналов^[1]:

1. с пуриновыми рецепторами (АТФ-активируемые);
2. с никотиновыми АХ-рецепторами, ГАМК-, глицин- и серотонин-рецепторами;
3. с глутаматными рецепторами.

При этом в одно и то же семейство попадают ионные каналы с разной ионной селективностью, а также с рецепторами к разным лигандам. Но зато образующие эти каналы белки имеют большое сходство в строении и происхождении.

Ионные каналы также можно классифицировать по селективности в зависимости от проходящих через них ионов: натриевые, калиевые, кальциевые, хлорные,протонные (водородные).

Анионные хемочувсвительные каналы

Тип	Класс	IUPHAR-рекомендованное имя	Ген	Синонимы
GABAA	alpha	α1 α2 α3 α4 α5 α6	GABRA1 GABRA2 GABRA3 GABRA4 GABRA5 GABRA6	EJM, ECA4
	beta	β1 β2 β3	GABRB1 GABRB2 GABRB3	ECA5
	gamma	γ1 γ2 γ3	GABRG1 GABRG2 GABRG3	CAE2, ECA2, GEFSP3
	delta	δ	GABRD
	epsilon	ε	GABRE
	pi	π	GABRP
	theta	θ	GABRQ
	rho	ρ1 ρ2 ρ3	GABRR1 GABRR2 GABRR3	GABAC[7]
Glycine (GlyR)	alpha	α1 α2 α3 α4	GLRA1 GLRA2 GLRA3 GLRA4	STHE
	beta	β	GLRB

Катионные cys-петлевые рецепторы

Тип	Класс	IUPHAR-рекомендованное имя	Ген	Синонимы
Serotonin (5-HT)	5-HT3	5-HT3A 5-HT3B 5-HT3C 5-HT3D 5-HT3E	HTR3A HTR3B HTR3C HTR3D HTR3E	5-HT3A 5-HT3B 5-HT3C 5-HT3D 5-HT3E
Nicotinic acetylcholine (nAChR)	alpha	α1 α2 α3 α4 α5 α6 α7 α9 α10	CHRNA1 CHRNA2 CHRNA3 CHRNA4 CHRNA5 CHRNA6 CHRNA7 CHRNA9 CHRNA10	ACHRA, ACHRD, CHRNA, CMS2A, FCCMS, SCCMS
	beta	β1 β2 β3 β4	CHRNB1 CHRNB2 CHRNB3 CHRNB4	CMS2A, SCCMS, ACHRB, CHRNB, CMS1D EFNL3, nAChRB2
	gamma	γ	CHRNG	ACHRG
	delta	δ	CHRND	ACHRD, CMS2A, FCCMS, SCCMS
	epsilon	ε	CHRNE	ACHRE, CMS1D, CMS1E, CMS2A, FCCMS, SCCMS
Zinc-activated ion channel (ZAC)		ZAC	ZACN	ZAC1, L2m LGICZ, LGICZ1

Ионотропные рецепторы глутамата образуют тетрамеры с каждой субъединицей, состоящей из внеклеточного домена аминоконцевой (ATD, который участвует тетрамера в сборе), внеклеточный лиганд-связывающий домен (LBD, которая связывает глутамат) и трансмембранный домен (TMD, который образует ионный канал). Трансмембранный домен каждой субъединицы содержит три трансмембранных спирали, а также половину мембранной спирали с возвратной петлей. Структура белка начинается с ATD на N-конце, за которым следует первая половина LBD, которая пересекается спиралями 1,2 и 3 TMD перед продолжением заключительной половины LBD, а затем заканчивая спиралью 4 ТВД на с-конце. Это означает, что есть три связи между ТВД и внеклеточных доменов. Каждая субъединица тетрамер имеет сайт связывания для глутамата, образованного двумя LBD участками, образующими раскладную форму. Только две из этих сайтов в тетрамере должны быть заняты, чтобы открыть ионный канал. Пора в основном формируется половинной спирали 2 таким образом, который напоминает перевернутую калиевый канал.

Тип	Класс	IUPHAR-рекомендованное имя	Ген	Синонимы
AMPA	GluA	GluA1 GluA2 GluA3 GluA4	GRIA1 GRIA2 GRIA3 GRIA4	GLUA1, GluR1, GluRA, GluR-A, GluR-K1, HBGR1 GLUA2, GluR2, GluRB, GluR-B, GluR-K2, HBGR2 GLUA3, GluR3, GluRC, GluR-C, GluR-K3 GLUA4, GluR4, GluRD, GluR-D
Kainate	GluK	GluK1 GluK2 GluK3 GluK4 GluK5	GRIK1 GRIK2 GRIK3 GRIK4 GRIK5	GLUK5, GluR5, GluR-5, EAA3 GLUK6, GluR6, GluR-6, EAA4 GLUK7, GluR7, GluR-7, EAA5 GLUK1, KA1, KA-1, EAA1 GLUK2, KA2, KA-2, EAA2
NMDA	GluN	GluN1 NRL1A NRL1B	GRIN1 GRINL1A GRINL1B	GLUN1, NMDA-R1, NR1, GluRξ1
		GluN2A GluN2B GluN2C GluN2D	GRIN2A GRIN2B GRIN2C GRIN2D	GLUN2A, NMDA-R2A, NR2A, GluRε1 GLUN2B, NMDA-R2B, NR2B, hNR3, GluRε2 GLUN2C, NMDA-R2C, NR2C, GluRε3 GLUN2D, NMDA-R2D, NR2D, GluRε4
		GluN3A GluN3B	GRIN3A GRIN3B	GLUN3A, NMDA-R3A, NMDAR-L, chi-1 GLU3B, NMDA-R3B
‘Orphan’	(GluD)	GluD1 GluD2	GRID1 GRID2	GluRδ1 GluRδ2

АТФ-зависимые каналы открываются в ответ на связывание нуклеотида АТФ. Они образуют тримеры с двумя трансмембранных спиралей на субъединицу при этом C и N концы в цитозоле.

Тип	Класс	IUPHAR-recommended protein name [6]	Ген	Синонимы
P2X	N/A	P2X1 P2X2 P2X3 P2X4 P2X5 P2X6 P2X7	P2RX1 P2RX2 P2RX3 P2RX4 P2RX5 P2RX6 P2RX7	P2X1 P2X2 P2X3 P2X4 P2X5 P2X6 P2X7